Axit HCl là một axít mạnh nên trước tiên nó gây ăn mòn da, thậm chí gây bỏng nếu tiếp xúc ở nồng độ cao. HCl đậm đặc có đặc tính bay hơi mạnh nên người tiếp xúc với nó có thể hít phải. Nhẹ thì gây ngứa, dị ứng niêm mạc mũi, miệng, mắt. HÍt nhiều có thể gây tổn thương phổi, thở khó. thậm chí có thể gây tràn dịch trong phổi, đau ngực. Nếu nuốt phải, gây đau bụng buồn nôn. Người tiếp xúc với hơi HCl lâu ngày men răng sẽ bị mòn, và bị vàng. Có thể gây hại gan và thận. Chưa có bằng chứng liên quan tới bệnh ung thư hay dị tật sinh sản.
