Một số câu hỏi về SHPT ?

Một số câu hỏi về SHPT ?

Anh Concay ơi, Tris base và Tris HCl có tác dụng gì trong electrophoretic buffer ???

TRIS is the short name commonly used for tris-(hydroxymethyl)aminomethane, a compound that is commonly used as a pH buffer in molecular biology/ biochemistry laboratory techniques. I''ll discuss buffers briefly in this answer, but we already have some answers in our archives that discuss buffers. You can find those here, here, and here, and you can also use our Search Engine to look for more answers about pH buffers.
In general, a pH buffer is used to maintain a solution within a narrow pH range when strong acids or bases are introduced to that solution. For example, most (if not all) enzymes have an optimal pH in which they will function, and it is important to make sure that they remain in this pH range while they are working. Perhaps the products of the enzyme activity are strong acids or bases; we don''t want these products to kill the activity of the enzyme.
In general, pH buffers are weak acids and bases that are present in a solution at high coincentrations. For biochemistry and molecular biology labwork, we tend to use what are called conjugate acid-base pairs to buffer our solutions. These are weak acids and bases that are forms of the same basic compound. When a strong acid or base is added to the solution, the weak base or acid of the buffer effectively neutralizes the strong acid or base, maintaining the pH. This system will work as long as the buffer exists in the solution in great excess over the volume of strong acid or base added to the solution.
The chemical formula of TRIS is (HOCH2)3CNH2. From the perspective of a pH buffer, the important part is the -NH2 group on the end. This group acts as a weak base. The conjugate acid (also called the salt) of TRIS is TRIS hydrochloride (aka TRIS HCl), which has the formula (HOCH2)3CNH3+ Cl-. Here, the important part is the -NH3+ group. TRIS HCl is a weak acid.
So, a TRIS HCl buffered solution is important to maintain a specific pH range for your DNA extraction. You didn''t specify the pH of the solution in your question, so you should check your protocol to make sure you are using the proper con***ions for your extraction.
You can find more information about TRIS in the Merck Index (which should be available in your local public or college library if it isn''t in your lab), and (in ad***ion to our archives) you should be able to find information about buffer systems in any college-level biochemistry textbook. I recommend "Biochemistry" by L. Stryer.
Good luck with your labwork, and keep asking questions!
http://www.madsci.org/posts/archives/1065809598.Bc.r.html
Concay

Bác concay .....Bác làm ơn dịch luôn bài viết của bác ra đi , với trình độ tiếng anh hạn hẹp của tôi , chẳng biết làm thế nào để dịch hoàn thiện bài này ,...tính ra với chuyên môn thì tôi cũng hiểu được " bập bõm " nhưng tôi hy vọng bác có thể đáp ứng nguyện vọng này của tôi , cũng như của khá nhiều thành viên...
<marquee>YÊU TẤT CẢ CÁC BẠN GÁI TRONG BOX CÔNG NGHỆ SINH HỌC NHẤT LÀ BACHHOP</marquee> [/size=7]

Đây không phải là bài viết của tôi mà do tôi copy từ 1 forum khác. Vì tôn trọng tác giả và nguyên bản nên tôi để như vậy. tôi có để đường link để mọi người tìm đến. Không khó để dịch và hiểu, rất giản đơn. Nếu có học qua Hoá Phân Tích, chắc chắn sẽ hiểu bài viết này. Nhờ mấy anh chị khác ra tay "cứu giúp" dùm.
Thân
Concay

Anh Concay trả lời như thế là không ổn rồi, vì như thế mới chỉ nêu ra được chức năng của Tris trong buffer thôi. Nếu coi Tris giữ chức năng cân bằng pH không cho lệch về bên nào thì tại sao người ta lại phải dùng tới hai loại Tris là Tris Base và Tris HCl. ????

Bài trả lời trong forum anh Concay trích dẫn cũng chỉ là để giải thích cho câu hỏi "Tris có vai trò gì trong quá trình tách chiết DNA" mà người hỏi nêu. Thực sự là chưa đầy đủ...

Cái này phải hỏi anh nào đã từng làm cụ thể cơ.
Có ai giúp được em không nhỉ ??????


To Ngoc_nam : You không dịch được thật à, hay là nói thế thôi ???? Nếu thế thì không biết đọc tài liệu thế nào nhỉ ?????

Bạn nên nghiềm ngẫm câu trả lời của thầy giáo người Mỹ kia và liên hệ câu hỏi của chính bạn. Nếu tôi trả lời 100% câu trả lời của bạn thì có thể sẽ tạo ra sự ỷ lại nơi bạn.
Nói 1 cách ngắn ngọn: tuỳ theo yêu cầu về pH của buffer mà người ta dùng Tris-HCl hay Tris-Base tương ứng.
Ví dụ
TAE Buffer 50X stock solution, 1 Liter
242 g Tris base
57.1 ml glacial acetic acid
100ml 0.5M EDTA, pH 8.0

TBE Buffer 10X stock solution, 1 Liter
108 g Tris base (89mM)
55 g boric acid (89mM)
40 ml 0.5M EDTA, pH 8.0 (2mM)

TE Buffer, pH 7.4, 7.5, or 8.0
10ml 1M Tris-HCl, pH 7,4
2ml 0,5M EDTA, pH8,0
adjust pH with concentrated HCl

TM Buffer 10X 100mM Tris-Cl, pH8.0
100mM MgCl2

Nghĩa là muốn pH cao thì xài tris base và ngược lại.
Concay

OK, đúng là em không để ý, vì chưa dùng buffer có pH dưới 8.0 bao giờ nên không có sự liên hệ và để ý giữa thành phần và pH.
Thanks. dù sao thì những người khác không quan tâm đến vấn đề này đọc qua cũng hiểu, cám ơn anh !
Em hỏi câu nữa được không, cũng liên quan đến E. buffer:
Tại sao stock solution của TBE hoặc TAE ở "độ đậm đặc" 10X hoặc working solution 1X, 0,5X.. để trong thời gian dài thì bị tủa trắng ở đáy lọ -trong trường hợp dùng dở (lấy ra để pha). Nếu lọ nguyên không dùng, không bị mở nắp sau khi pha, thì không có hiện tượng này. Em không hiểu bản thân buffer có thể bị thay đổi pH trong quá trình bảo quản dẫn đến hiện tượng này không, vì thêm một chút NaOH vào thì tủa tan ngay, như vậy có ảnh hưởng gì đến pH tổng thể của dung dịch ??
pH của toàn thể dung dịch TAE (hoặc TBE ) có phải phụ thuộc vào pH của EDTA không (vì sau bước chuẩn pH EDTA, không thấy yêu cầu chuẩn lại pH) ???

Em sẽ hỏi rất nhiều câu liên quan đến những vấn đề rất cụ thể. Biết rằng anh Concay khá bận với công việc của mình, nhưng vẫn mong được anh và những người khác giúp đỡ để không chỉ em mà còn nhiều người khác có cơ hội học hỏi !!

Cám ơn nhiều .

về câu hỏi củsa bạn, nếu có học và để ý 1 chút đến Hoá Phân tích thì sẽ có ngay câu trả lời, tôi gợi ý để bạn tìm hiểu nhé:
01- Bạn thử suy nghĩ về vai trò của CO2 (cacbonic) trong không khí, khi nó gặt nước, kết quả sẽ ra sao???
02- bạn thử tra sách vở coi EDTA là chất gì, hữu cơ hay vô cơ, tính acid-base của nó thế nào để biết là nó có ảnh hưởng để pH của dd hay không.
rất thích các câu hỏi của bạn, nên cứ mạnh dạn post lên nhé.
Thân
Concay

Em đây, cám ơn anh đã trả lời câu hỏi của em theo hướng gợi mở như thế.
Thực ra ngay trong câu hỏi của em đã nêu rõ nguyên nhân rồi, có điều em vẫn cứ hỏi vậy, vì hai lý do:

- Một là để kiểm chứng lại phán đoán của mình xem có đúng vậy không.
- Hai là để các thành viên khác nếu có đọc cũng thấy vấn đề và cách giải quyết.
- Ba là làm cái gì đó để Box đỡ vắng hoe, vì nhiều người kêu vào đây chả có gì thú vị. Ít ra theo em trong box có một MOD rất nhiệt tình và hiểu biết rộng.
Em sẽ tiếp tục hỏi, toàn câu hỏi nghe có vẻ ngớ ngẩn nhưng thực ra rất ít người để ý đến những điều lặt vặt đó.
Em thích cách trả lời của anh đối với một câu hỏi, vì đầy tính khoa học, đòi hỏi người đặt câu hỏi phải tự suy xét vấn đề theo hướng đã gợi mở, điều này SV VN ít được tiếp cận mà chỉ tư duy một cách máy móc....
Em sẽ còn hỏi tiếp !

nếu bạn đang làm về Buffer tôi có vài câu hỏi đặt ra cho bạn:
01. Có khá nhiều hệ đệm như là K2HPO4 và các muối tương ứng; hệ NaOH /HCl, vậy tại sao khi chạy eletrophoresic, người ta kô dùng hệ đệm này mà dùng Tris-HCl? Ngược lại khi pha chế các môi trường nuôi VSV, người ta lại dùng hệ đệm Vô cơ nói trên??
02. Vai trò của EDTA trong dd đệm mà bạn pha?
Concay