1. Tuyển Mod quản lý diễn đàn. Các thành viên xem chi tiết tại đây

SOS ! Help me ! DNA sequencing !

Chủ đề trong 'Công nghệ Sinh học' bởi kata_vtm, 14/02/2006.

  1. 0 người đang xem box này (Thành viên: 0, Khách: 0)
  1. kata_vtm

    kata_vtm Thành viên mới

    Tham gia ngày:
    08/09/2003
    Bài viết:
    44
    Đã được thích:
    0
    Bà con ơi ! Giúp em với, em đang làm đồ án về Hệ thống giải trình tự gien tự động nhưng lại không phải dân chuyên ngành sinh học nên nhiều vấn đề rất lơ mơ...
    Hiện nay em đang cần tài liệu giải thích rõ về cách đọc kết quả phân tích gien sau khi tiến hành điện di, bác nào có thì share với, cám ơn rất nhiều...
  2. weirdhobbit

    weirdhobbit Thành viên quen thuộc

    Tham gia ngày:
    19/05/2002
    Bài viết:
    165
    Đã được thích:
    0
    Trời, giờ này mà còn tìm tài liệu về phân tích gel sau khi điện di làm gì? người ta bi giờ toàn dùng kĩ thuật capillary electrophoresis trong các máy giải trình tự tự động thôi, máy đời mới nhất hiện giờ hình như giải trình tự được 96 mẫu/2-3 giờ, mỗi mẫu khoảng 600-700 bp. Muốn kiếm tài liệu thì tra thử google capillary electrophoresis coi thế nào?
  3. kata_vtm

    kata_vtm Thành viên mới

    Tham gia ngày:
    08/09/2003
    Bài viết:
    44
    Đã được thích:
    0
    Cảm ơn ý kiến của bác weirdhobbit, em không phải dân chuyên ngành sinh mà. Em là dân điện tử, và cái máy capillary electrophoresis chính là nội dung đồ án của em đó. Trình bày cụ thể hơn nhé: với kỹ thuật điện di bình thường thì chúng ta đọc trình tự ngay trên bản gien nhưng với hệ thống tự động thì nó sử dụng hệ thống cảm biến quang học giúp tăng độ chính xác lên rất cao. Do đó em muốn hỏi xem bt mình đọc bản điện di ntn thì mới tìm ra được cách máy nó đọc thế nào... Tài liệu tiếng Anh em đã có 1 ít và vẫn đang tìm kiếm, nếu bác nào trong nghề và thông thạo thì giúp cho 1 chút để tiết kiệm thời gian thôi, cám ơn lắm lắm !
    Mẹc, tự dưng chọn cái đồ án phức tạp quá, sinh, vật lý, điện tử... tài liệu toàn phải tự mò, nhức đầu ghê... /_
  4. vietbio

    vietbio Thành viên mới

    Tham gia ngày:
    29/09/2004
    Bài viết:
    59
    Đã được thích:
    0
    công nghệ đetect về cơ bản là như nhau (1 dòng laser để kích hoạt các chất huỳnh quang gắn trong DNA và dùng detecter để ghi lại signal), khác nhau chi tiết là phụ thuộc hãng sx chứ ko phải bước tiến từ sequencer bản gel sang capillary. Cái sequencer sử dụng capillary chỉ có tác dụng mẫu phân tách tốt hơn (còn phụ thuộc chuẩn bị sample), tốc độ sequencing nhanh hơn (1 chút), signal bắt nhạy hơn (cũng còn phụ thuộc detecter). Nói túm lại chỉ có cái chắc chắn hơn là phải dùng ít gel hơn :)) hehe nhưng lại phải thay capillary sau 1000 runtime.
    Chạy bình thường thì sequencer phải chạy được 1000 đến 1200bp chứ (có khi sample tốt còn được hơn chứ nhỉ).
  5. weirdhobbit

    weirdhobbit Thành viên quen thuộc

    Tham gia ngày:
    19/05/2002
    Bài viết:
    165
    Đã được thích:
    0
    Standard sequencing hông có máy nào chạy quá 700 bp đâu bạn, coi lại đi. Máy ABI loại to nhất, đời mới nhất bi giờ là 3730xl phải chạy chế độ long read mới được >1000bp thôi, standard vẫn là 700bp. Sample tốt hả, 700bp đó là tính độ chính xác 98.5%, bạn đã từng nhìn mẫu vừa ''đạt chuẩn" 700bp với 98.5% accuracy chưa? chỉ xài được chừng 600 bp thôi.
    Tôi thấy trang này cũng dễ đọc và có hình minh họa cách đọc gel, rất đơn giản
    http://www.bio.davidson.edu/Courses/Molbio/MolStudents/spring2003/Obenrader/sanger_method_page.htm

Chia sẻ trang này