Ứng dụng ERP vào quản lý là một bước phát triển tất yếu sau nhiều năm các doanh nghiệp Việt Nam đã áp dụng các hệ thống phần mềm kế toán tài chính. Việc có áp dụng được giải pháp ERP hay không trước hết đòi hỏi phải chuẩn hoá được quy trình nghiệp vụ, đây là lý do mà không phải doanh nghiệp nào cũng dùng được ERP. Khi doanh nghiệp đã thực sự hướng tới một văn hoá quản lý rành mạch, nghiêm túc hãy sử dụng ERP. Cần phải có một kế hoạch cụ thể, cân nhắc thấu đáo cho việc ứng dụng ERP, việc ứng dụng phải đi từ thấp đến cao để tránh được các rủi ro. Vấn đề chủ yếu là các thành viên từ nhân viên đến lãnh đạo trong doanh nghiệp đều cần thời gian để làm quen với ERP và những sự thay đổi trong cách làm việc đi kèm với việc áp dụng ERP. Các giai đoạn tuần tự để doanh nghiệp có thể triển khai ERP hiệu quả gồm: Bước 1: Sẽ tiến hành đem ERP đến với các phân hệ hệ liên quan đến kế toán tài chính. Chức năng của các phân hệ này vẫn như chắc năng của một phần mềm kế toán như các doanh nghiệp đã dùng hiện nay. Chính vì thế, giai đoạn này sẽ tương đối dễ dàng. Các nghiệp vụ chính của một hệ thống ERP thường đáp ứngBước 2: Tiếp tục triển khai các phân hệ liên quan đến hậu cần, bao gồm: quản lý kho, quản lý việc giao nhận hàng….Các phân hệ kế toán ngay lập tức sẽ được tích hợp thêm các phân hệ này. Kết quả của bước 2 là ERP sẽ quản lý hầu hết mọi phòng ban trong doanh nghiệp, chỉ ngoại trừ dưới phân xưởng. Giai đoạn 3: Áp dụng với doanh nghiệp sản xuất, tiến hành triển khai các phân hệ liên quan đến giá thành sản phẩm và quản lý sản xuất. Đối với từng hệ thống ERP khác nhau mà việc quản lý có thể được chi tiết đến mức quản lý giờ công lao động, quản lý từng giờ máy. Có thể triển khai giai đoạn 1 và 2 tại mọi doanh nghiệp, nhưng còn đối với giai đoạn 3, muốn triển khai được đòi hỏi việc sản xuất của doanh nghiệp phải tương đối quy củ và hiện đại. Tuy nhiên doanh nghiệp có thể chọn cho mình giải pháp áp dụng ERP đến giai đoạn 2. Nói chung trong thời gian mấy năm tới áp dụng được ERP đến giai đoạn 3 sẽ chỉ tập trung vào một số doanh nghiệp đầu đàn. Trước khi muốn áp dụng ERP hãy chắc rằng mình hiểu được ERP làm được gì và sẽ không làm được gì. Các nhà quản lý cần phải nhớ ERP không hỗ trợ để tạo ra sự thay đỏi về quy trình làm việc, mà việc này phải được thực hiện trước khi áp dụng ERP. Việc sử dụng ERP sẽ giúp cho nhà quản lý tạo ra được cơ chế kiểm soát nội bộ đáng tin cậy cũng như tạo ra một nhịp làm việc đồng bộ mà ở đó có sự phân chia trách nhiệm rõ ràng, nhưng vẫn phối hợp chặt chẽ giữa các bộ phận với nhau trong doanh nghiệp.